小分子藥物
由于具有高質量動力學的純動力學特性，SPR是一種直接測量小分子的強大而靈敏的工具。
SPR用于小分子相互作用
SPR作為一種敏感的平臺，可以決定藥物-靶向相互作用，對于小分子同樣適用。可以顯示實時的無標記親和性和動態的相互作用檢測。針對不同的分析物(核苷酸、肽、藥物分子、抗體、病毒等)優化不同的配體(蛋白質、核苷酸、肽、受體、膜受體、抗體等)。其相互作用的測量可以在不同的液體中進行，包括復雜的液體，如血清，唾液或有機溶劑。
選擇SPR來測量小分子的5個理由:
1. 直接測量小分子
2. 通過動力學可以得到高質量的數據
3. 低成本
4. 很容易從靶向研究向內部化研究轉變
5. 應對生物制藥發展和制造業的新挑戰
關于SPR可以回答的關于小分子的4個關鍵問題：
1. 小分子藥物與蛋白質的親和力是多少?
2. 分子X與分子Y相互結合和解離的速度有多快？
3. 哪種藥物分子是最好的結合受體？
4. 藥物從材料中的釋放的速率是多少？
DNA定量檢測應用
DNA檢測可以用于檢測遺傳物質，以檢測基因突變、突變、基因轉染或來自大量樣本的物種。通過對超過20個核苷酸的特定單鏈寡核苷酸進行分析，可以從大量遺傳物質中檢測和量化獨特的基因序列。27個單位的寡核是自吸附在一個標準的黃金感應表面上的。使用一種(2-羥基乙基)-脂酰胺分子，在表面上吸附了非特異性結合。對具有互補序列的單鏈dNA樣品進行了檢測，并對相同的透鏡和牛血清白蛋白(BSA)的非互補dNA進行測試。Sensby SPR在廣泛的濃度范圍(0.1nM至10μM)中表現良好非互補dNA和1000nM的BSA無信號響應。
藥物與細胞的相互作用應用
體外細胞檢測在藥物研發過程中被廣泛使用。通常來說，這些需要標記的材料，是基于紫外線、熒光或質譜分析的后發現。多參數的SPR能夠實時測量在未標記的情況下的交互，在一個恒定的和控制的流動條件下。SPR測量寬角度范圍和整個SPR曲線，可以觀察幾個參數。madin-darby犬腎臟(MDCKII)細胞單層細胞沉積在黃金傳感器幻燈片上。成功地測定了小分子體重藥物普萘洛爾醇和d-mannitol與細胞單層細胞的相互作用。在刺激后，部分普萘洛爾仍留在細胞層，而d-甘尼醇被移除。通過對SPR的測量，甚至可以區分準細胞和細胞外藥物吸收路徑。
用SPR測量小分子量藥物蛋白相互作用
SPR可以測量一種小分子量藥物與人類血清白蛋白(HSA)的相互作用。HSA被連接到一個帶有胺耦合化學的傳感器表面。通過SPR，確定了力壓的親和力(KD)和動力學常數(ka和KD)。利用動力學，將體積效應與結合動力學分離開來，確保了優質的動力學數據。
